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Geostatistical Analyst は、Spatial Analyst の機能を補う製品です。Spatial Analyst の補間手法のほとんどは、Geostatistical Analyst でも利用できます。さらに Geostatistical Analyst は、より多くの統計モデルやツールを備えており、それらのパラメータを調節して最適なサーフェスを導き出すことができます。一方、Spatial Analyst には、セルベースの演算、データ変換など、他の機能が多くあります。
Spatial Analyst は基本的な補間手法を備えていますが、Geostatistical Analyst は決定論的な補間手法と地球統計学に基づく補間手法を数多く揃え、その他多くの補間に特化した機能を提供します。特に、Geostatistical Analyst は、予測、確率、変位値、予測エラーなどの様々なサーフェス出力が可能です。サーフェスは、グリッド、コンター、塗りつぶしコンター、陰影起伏や、これらのレンダリングの組み合わせで表現できます。これらのサーフェスはラスターまたはベクター形式でエクスポートでき、Spatial Analyst などの他のエクステンション製品と連携できます。Geostatistical Analyst にはまた、データ値の分布調査、ローカル/グローバルの異常値特定、グローバルなトレンド把握、データ値の空間的独立性調査が行える対話的な ESDA(空間データ解析調査)ツールが含まれます。